Das Nationale Referenzlaboratorium für Listerien ist zuständig für die Differenzierung bzw. Charakterisierung von Listerienisolaten aus Lebensmitteln und Umfeldproben.

Die eingelangten Isolate werden mittels Ganzgenomsequenzierung typisiert. Zur Abklärung epidemiologischer Fragestellungen wie etwa der Bestätigung eines lebensmittelbedingten Listerioseausbruchs werden die Sequenzen mittels core genome MLST (cgMLST) Analyse ausgewertet. Diese vom Nationalen Referenzlaboratorium verwendete Methode wurde 2015 gemeinsam mit der Uniklinik Münster und Ridom Bioinformatics entwickelt und findet seitdem internationale Verwendung. Das cgMLST Schema ist in der Software Ridom SeqSphere+ integriert. Zur Typisierung werden 1701 definierte Zielsequenzen analysiert und über einen Nomenklaturserver abgeglichen.

• Typisierung von Listeria monocytogenes Isolaten mittels Genomsequenzierung
• Auswertungen zu Genomsequenzierungen (core-genome Analyse) auf Anfrage
• Stammsammlung
• Ausbruchsabklärung